Investigación sobre leishmaniasis participará en encuentro internacional

Con el fin de presentar y reconocer el trabajo conjunto entre las redes académicas del país, que busquen impactar positivamente la investigación científica, la Red Nacional Académica de Tecnología Avanzada (RENATA) y RUTA Caribe, abrieron una convocatoria para que diferentes entidades presentaran sus desarrollos y avances.

El Centro de Bioinformática y Biología Computacional de Colombia - BIOS, en representación de la red académica caldense RADAR y la Universidad de Antioquia como integrante de la red académica antioqueña RUANA, presentaron un documento conjunto sobre la simulación y modelamiento de proteínas de leishmaniasis, el cual fue aceptado para participar en el Tercer Encuentro Internacional de E-Ciencia en Barranquilla, Atlántico, del 13 al 14 de mayo de este año.

Gracias al programa 3CoA (Comunidad Colombiana de Computación Avanzada) de RENATA se hizo el puente entre PECET, grupo de investigación de la Universidad de Antioquia  y BIOS, lo que ayudó a la transferencia rápida y oportuna de datos de entrada y salida pertenecientes al flujo de trabajo bioinformático propuesto, en el cual el PECET se encargaba de la preparación y análisis de las datos, y el Centro ejecutaba los respectivos cálculos.

Hasta el momento se han modelado y validado 18 proteínas. El propósito posterior de este proyecto es realizar revisiones en distintas librerías virtuales y seleccionar una lista de potenciales compuestos anti-Leishmania que sean validadas experimentalmente, con el objetivo de aumentar el impacto de este proyecto.

Esta investigación fue realizada por Rodrigo Ochoa, Diego Guerra y Carlos Muskus, de PECET , Juan Carlos Correa y  Diego Ceballos de BIOS.

Para Ceballos “la Universidad de Antioquia necesitaba simular la modelación de estas proteínas y necesitaban infraestructura computacional, luego de realizar esta investigación, supimos de la convocatoria de RENATA y decidimos participar y construir el documento y el póster. Recibimos la buena noticia que fuimos aceptados”.

Esta investigación se realizó sobre el clúster Linux de BIOS.

Según Juan Carlos Correa, en el documento se explica cómo fue el proceso de la investigación, “en general se utilizaron alrededor de 14 a 15 cores por simulación, con un promedio de memoria RAM de 10 GB. El tiempo promedio de cálculo fue de 19.62 horas, teniendo en cuenta que se procesaron dos modelados simultáneamente”.

PECET y BIOS presentarán dicho avance en un póster en este evento, uno de los premios es participar en las charlas y talleres.

El trabajo conjunto entre RADAR y RUANA, una importante muestra de que al unir las capacidades entre diferentes entidades, se pueden sacar adelante grandes investigaciones.

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